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南京醫科大學第二附屬醫院檢驗醫學中心設有臨床生物化學實驗室、臨床免疫學實驗室、臨床微生物學實驗室，臨床細胞學實驗室、輸血實驗室、臨檢實驗室和急診檢驗實驗室。中心于2019年8月26日通過中國合格評定國家認可委員會（CNAS）醫學實驗室質量和能力認可，符合ISO15189:2012醫學實驗室質量和能力要求。

中心裝備有Roche P800 全自動生化分析儀、Beckman ACCESS-2-DIX800 化學發光分析儀、SimensBN-II特定蛋白儀、Roche Cobas 602電化學發光分析儀、Abbotti2000電化學發光分析儀、Ausbio ELISA Star全自動酶免儀、Sysmex 系列全自動血液分析儀、Roche全自動尿液分析儀、BioMerieux VITEKCampat全自動微生物鑒定藥敏分析儀、SebiaHydrasys LC全自動凝膠電泳儀等一大批的先進的檢驗設備，開展各類檢驗項目近500項，可以滿足臨床各學科所需。

中心現有各類專業技術人員83人，其中高級職稱21人，中級職稱28人。本科以上學歷占82%，具有博士學位4人，碩士學位（含同等學力）12人。博士研究生導師1人，碩士研究生導師2人，近5年來承擔國家自然科學基金2項，省級課題3項，在國內、外期刊發表學術論文30余篇，其中SCI收錄近20篇，主（參）編專著多部。

學科帶頭人朱葉飛，醫學博士，教授，研究員，南京醫科大學博士研究生導師，約翰斯霍普金斯大學訪問學者，江蘇省第五期“333高層次人才培養工程”第二層次培養對象，研究方向為腫瘤和病原微生物實驗室診斷，承擔和參與國家級及省級課題多項，在國內外發表學術論文110余篇，出版專著兩部，獲得2014年江蘇省科學技術獎二等獎和中華醫學科技獎二等獎，分別擔任江蘇省生物醫學工程學會體外診斷技術專業委員會副主任委員、江蘇省婦幼健康研究會第一屆檢驗醫學專業委員會副主任委員、江蘇省婦幼保健協會醫學檢驗分會第一屆委員會副主任委員、江蘇省醫學會檢驗學分會委員會委員、江蘇省醫院協會臨床檢驗管理專業委員會常務委員、江蘇省中西醫結合學會檢驗醫學專業委員會常委委員和南京市醫學會檢驗專科分會副主任委員。